В кишечнике имеется три вида движений: маятникообразные – перемешивающие, продигающие вперед – перистальтика, и антиперистальтика (только в толстом кишечнике) – продвижение химуса по направлению к ротовому концу. Регуляция моторики осуществляется автономными нервными сплетениями, центральными образованиями (гипоталамус) и гормональными – центральными и автономными. Соотношение тонуса регулирующих элементов и определяет характер стула.
В настоящее время эти механизмы практически не изучаются, поскольку имеют не значительное клиническое значение – имеется слабая взаимосвязь между формой кала и проявлением заболеваний.