Очень сложно Вам ответить заочно. Во-первых, обычная «инфекция» не вызывает таких изменений, как Вы описываете. Во-вторых, депофорез – это как разновидность электрофореза, т.е.это не панацея. Иначе говоря, причина патологии осталась не выясненной.
Наверно лучшим выходом будет обратиться в вышестоящую стомат организацию – кафедру стоматологии, областную/ городскую стоматполиклинику. Считаю, что с открытыми каналами оставаться нельзя.